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Protocolli alternativi di fissazione dei tessuti riducono drasticamente l’impatto degli artefatti del DNA, evidenziando l’interpretazione del profilo genomico completo clinico

Siamo entusiasti di condividere i risultati di un nuovo studio condotto sui protocolli alternativi di fissazione dei tessuti.

Lo studio potrebbe rivoluzionare l’interpretazione della profilazione genomica clinica completa, perchè ha evidenziato importanti e significativi risultati.
Nella pratica clinica di routine, l’analisi del profilo genomico completo mediante pannelli mirati di sequenziamento di nuova generazione (NGS) svolge un ruolo cruciale nell’oreintare le decisioni terapeutiche per i pazienti in fase avanzata. Tuttavia, l’uso di campioni FFPE (formalin-fixed paraffin-embedded) spesso ostacola l’estrazione di materiale genetico di alta qualità, compromettendo l’affidabilità dei dati di sequenziamento.

Nel corso di questo studio innovativo, i ricercatori hanno valutato la qualità del materiale genetico estraibile fissando i campioni alternativamente in formalina neutra tamponata (NBF) o in fissativi privi di acidi: formalina priva di acidi (ADF) e Glyoxal Acid-Free (GAF).
Tra questi fissativi, l’NBF è risultato il meno performante in termini di conservazione e sequenziamento del DNA rispetto ai fissativi privi di acido.

In particolare, GAF® si è distinto come l’unica opzione non cancerogena che supera gli artefatti e la scarsa conservazione del DNA osservati nella fissazione con Formalina.

L’uso di fissativi privi di acidi apre la possibilità di implementare tecniche di profiling molecolare più complesse su campioni di tessuto.
Questo notevole risultato rappresenta un progresso significativo per i pannelli di sequenziamento di nuova generazione (NGS), in particolare nei casi in cui un’analisi completa del profilo genomico è indispensabile per prendere decisioni informate sul trattamento.

Lo studio è disponibile al link:

Alternative protocols of tissue fixation dramatically reduces the impact of DNA artifacts, unraveling the interpretation of clinical Comprehensive Genomic Profiling

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